A+ A A-

Milk protein polymorphism study in the Algerian sheep breed Hamra

A. AMEUR AMEUR1,2*

MT. BENYOUCEF2

M. AMRANI4

SBS. GAOUAR3

 

1 Department of agronomical sciences, University of Bouira (UAMO), Algeria

2 National Superior School of Agronomy, (ENSA - ES1603), Algeria

3 Department of Biology, University of Tlemcen, Algeria

4 Laboratory of Biology of Microorganisms and Biotechnology, University of Oran, Algeria

 

Abstract - In sheep, the polymorphism of major milk proteins is reduced as compared with other ruminant species, like cattle and goats. As in other ruminant species, in sheep these polymorphisms were studied relative to milk quantity, quality and its manufacturing properties or for authenticity identification of dairy products. In Algeria, data concerning the characterization of the sheep breeds in the six loci codifying for major milk proteins genes are almost absent. The purpose of our study was to determine milk protein polymorphism in local sheep breed, using 30 samples of milk from local sheep breeds Hamra. Our work consisted in the isolation and characterization of milk proteins. For this, we used the precipitation of caseins pHi (pH 4.6). After extraction, purification and assay, both casein and serum protein fractions were then assayed by the Bradford method and separated by SDS-PAGE. Milk protein variants were determined by the molecular weight in gel using a molecular weight proteins ranging from 10 to 250 kDa. The electrophoretic pattern of milk samples showed the presence of four major caseins variants (αs1-, αs2- β- and k-casein) and two whey proteins (β-lactoglobulin, α-lactalbumin). Our study on percentage analysis of protein fractions of interest revealed that caseins represented 79.16% of the total protein of sheep milk, followed by whey proteins with 20.43%. According to the standards, the total ovine milk proteins showed a molecular weights, which are respectively (33, 32, 28 and 27 kDa) for caseins fraction and The β-lg, α-la fractions were determined to be around 19 and 15 kDa respectively. Further studies (Real Time qPCR) are requisite for certitude of the results on the polymorphic genes of proteins from sheep milk, in order to identify the genetic variants from the locus of each protein.

 

Keywords: Caseins, Hamra, Protein Polymorphism, Sheep milk, SDS-PAGE

 

Read more

Possibilités de substitution des moyens chimiques par une lutte biologique contrela cochenille blanche du palmier dattier Parlatoria blanchardi targ., 1868 (Homoptera, Diaspididae) dans les palmeraies de Biskra en Algérie.

A. ACHOURA1

M. BELHAMRA2

 

1 Université Mohamed Kheider, Département d’Agronomie, Biskra-Algérie

2 CRSTRA, Biskra-Algérie.

 

Abstract-We realized this study in the Algerian South in the region of Biskra, approximately Southeast 422 km from the capital Algiers. We chose a plot of land of palm tree date palm situated in the regional station of the protection of the vegetables (S.R.P.V) of Feliache. This one is in South East 6,5 km of the city of Biskra. The evolution of thesepest-related ecological,biotic or abiotic, they limitthe proliferationof this insect. Biotic factorsare represented bythe study ofpredation ratesto allow assessmentofpredatory activitythat can contribute tothe destruction of thewhitescale insect. The resultsshowed that thepredatory activityis very markedin the spring whenconditions are favorableto the proliferation of predators. In the region of Biskra, two families of beetles contribute in limiting the population of the mealybug white. The Coccinellidae are represented by two species Pharoscymnus ovoideus and Pharoscymnus numidicus,andNitidulidae are represented by Cybocephalus palmarum. Their operation can be used for possible biological control works by eliminating chemical means usually used.

 

Keywords: Biskra, The white scale insect, date palm, predator

 

Résumé - Nous avons réalisé cette étude au sud Algérien dans la région de Biskra, environ 422 km Sud-est de la capitale Alger. Nous avons choisi une parcelle de palmier dattier située dans la station régionale de la protection des végétaux (S.R.P.V) de Feliache. Celle-ci se trouve à 6,5 km Sud Est de la ville de Biskra. Notre étude montre que l’évolution de ce ravageur est liée aux différents facteurs écologiques biotiques ou abiotiques qui limitent sensiblement leur pullulation. Les facteurs biotiques sont représentés surtout par les prédateurs, qui contribuent fortement à la destruction de ce déprédateur. Les résultats obtenus montrent que l’activité prédatrice est très marquée au printemps lorsque les conditions écologiques sont favorables au développement des prédateurs. Dans la région de Biskra, deux familles de coléoptères contribuent dans la réduction des effectifs de la cochenille blanche. Celle des Coccinellidae représentée par deux espèces :Pharoscymnus ovoideus et Pharoscymnus numidicus, et celle des Nitidulidae réprésentée par Cybocephalus palmarum. Leur exploitation peut servir à d’éventuels travaux de lutte biologiques en éliminant les moyens chimiques habituellement utilisés.

 

Mots clés: Biskra, cochenille blanche, palmier dattier, prédateur.

 

Read more

Effet de la supplémentation en enzymes fibrolytiques exogènes sur la cinétique de production de gaz in vitro d’une paille d’avoine traitée ou non par voie chimique

J. JABRI*

H. YAICH

K. ABID

A. MALEK

J. REKHIS

M. KAMOUN

 

École Nationale de Médecine Vétérinaire, Service d’alimentation et de nutrition animale : Sidi Thabet – Tunis, Tunisie.

 

Abstract-For ruminants, the effect of supplementation with exogenous fibrolytic enzymes on digestibility of by-products, like straws, remains poorly studied. Then the in vitro gas production technique was used to evaluate the effect of a combination of different chemical pretreatments and exogenous fibrolytic enzymes (EFE) on fermentative characteristics and digestibility of oat straw. To enhance its protein content, this straw was submitted to three different types of chemical pretreatments. These were carried out successively with NH3, urea and sodium hydroxide. For supplementation, an enzymatic complex consisting of a mixture of cellulase and xylanase (1:1, v/v) was used in a dose of 0.6 mg / g DM. The analyzing of a factorial design (4 × 2) showed that most combinations between chemical pretreatments and EFE have no significant effect on the parameters of the gas production kinetics. However, only the pre-treatment combined the sodium hydroxide with EFE improves significantly the maximum rate of fermentation. This passes from 1.54 to 3.21ml / h respectively for the control straw and treated straw with sodium hydroxide and EFE. On the other hand, pretreatment with NH3 and urea or not combined with EFE improve the digestibility of the organic matter and the energy value of the straw studied. However, these two pre-treatments, combined or not with EFE, have the same effect. Therefore, it can be confirmed that the effect of chemical pretreatment dominates that EFE supplementation. So, we can conclude that the supplementation with EFE combined with NH3 or urea pre-treatment improves the maximum rate of fermentation and the digestibility of the studied oat straw.

 

Keywords: cellulase, chemical pretreatment, gas production, xylanase

 

Résumé - Chez les ruminants, l’effet de la supplémentation en enzymes fibrolytiques exogènes sur l’utilisation digestive des sous-produits agro-alimentaires, notamment les pailles, reste mal étudié. La technique de production de gaz in vitro a été utilisée pour examiner l’effet d’une combinaison entre différents prétraitements chimiques et des enzymes fibrolytiques exogènes (EFE) sur les caractéristiques fermentaires et l’utilisation digestive de la paille d’avoine. Afin d’améliorer sa valeur protéique en particulier, cette paille témoin a été soumise à trois types de prétraitements chimiques différents. Ces derniers ont été réalisés successivement avec l’NH3, l’urée et la soude. Pour la supplémentation, un complexe enzymatique constitué d’un mélange de cellulase et de xylanase (1:1, v/v) a été utilisé suivant une dose de 0.6 mg/g MS. L’analyse d’un modèle factoriel (4×2) a montré que la plupart des combinaisons entre les prétraitements chimiques et les EFE n’ont pas d’effet significatif sur les paramètres de la cinétique de production de gaz. Cependant, seul le prétraitement à la soude combiné aux EFE améliore significativement la vitesse maximale de fermentation. Celle-ci passe de 1.54 à 3.21ml / h respectivement pour la paille témoin et la paille traitée par la soude et les EFE. D’autre part, les prétraitements à l’NH3 et à l’urée combinés ou non avec les EFE améliorent d’une manière hautement significative la digestibilité de la matière organique et la valeur énergétique de la paille étudiée. Cependant, ces deux prétraitements, combinés ou non avec les EFE, présentent le même effet. Par conséquent, on confirmerait que l’effet du prétraitement chimique domine celui de la supplémentation en EFE. On peut conclure que la supplémentation en EFE combinée avec un prétraitement à l’NH3 ou à l’urée améliore la vitesse maximale de la fermentation et l’utilisation digestive de la paille d’avoine étudiée.

 

Mots clés:cellulase,prétraitementchimique,production de gaz,xylanase

 

Read more

Effet des enzymes fibrolytiques exogènes sur l’utilisation digestive de trois types de grignons d’olives

H. YAICH*

J. JABRI

K. ABID

A. MALEK

J. REKHIS 

M. KAMOUN

 

ÉcoleNationale de MédecineVétérinaire, Service d’alimentation et de nutrition animale : SidiThabet – Tunis, Tunisie

 

Abstract-In Tunisia, the olive cake are available in large quantities, they are characterized by a very limited nutritional value. The effect of supplementation with exogenous fibrolytic enzymes (EFE) on digestibility of these by-product remains poorly understood until our days. In this context, we propose to study the effect of such supplementation on digestibility and energy value of 3 types of olives cakes: crude olive cake exhausted olive cake (crude olive cake treated with a solvent) and defatted residue (crude olive cake heat treated followed by a solvent). Therefore, the gas production technique using syringes was used to determine the fermentation parameters of the food. An enzymatic complex containing a cellulase-xylanase mixture (1: 1, v / v) was used at two concentrations: C60 = 60 mg / gDM and C120 = 120 mg / g DM. Besides the various parameters of kinetics of gas production, the digestibility of the organic matter (OMD), the content of metabolisable energy (ME) and the production of volatile fatty acids (VFA) have been the subject of this study. Compared to the control (C0), the use of EFE improves significantly OMD, EM and VFA. This effect seems to be more effective for defatted and especially with C120. For crude olive cake and exhausted olive cake, the supplementation with EFE has a beneficial effect on these studied parameters but the difference between the two concentrations (C60 and C120) has no effect. We note that this supplementation has improved only the theoretical maximum gas production without affecting the lag time and the maximum rate gas production

 

Keywords: cellulase, digestibility, olive cake, xylanase

 

Résumé- En Tunisie, les grignons d’olives qui sont disponibles en quantité sélevées, se caractérisent généralement par une valeur nutritive très limitée. L’effet d’une supplémentation en enzymes fibrolytiques exogènes (EFE) sur l’utilisation digestive de ce sous-produit reste jusqu’à nos jours peu élucidé. Dans ce contexte, nous proposons d’étudier l’effet d’une telle supplémentation sur la digestibilité et la valeur énergétique de 3 types de grignons d’olives: grignons bruts (GB), grignons épuisés (GE) (GB traités par un solvant) et grignons dégraissés (GD) (GB traités par la chaleur puis par un solvant). De ce fait, la technique de production de gaz (PG) in vitro dans les seringues a étéutilisée pour déterminer les paramètres fermentaires de l’aliment. Un complexe enzymatique constitué d’un mélange cellulase-xylanase (1:1, v/v) a été utilisé à deux concentrations : C60= 60 mg/g MS et C120=120 mg/g MS. A part les différents paramètres de la cinétique de PG, la digestibilité de la matière organique (dMO), la teneur en énergie métabolisable (EM) et la production des acides gras volatils (AGV) ont été également étudiées. Par rapport aux aliments témoins (C0), l’utilisation des EFE a amélioré d’une manière très hautement significative la dMO, l’EM et l’AGV. Cet effet parait nettement meilleur pour les GD et particulièrement avec C120. Pour les GB et les GE, la supplémentation en EFE présente un effet bénéfique sur les paramètres étudiés mais la différence entre les deux concentrations (C60 et C120) est non significative. On note que cette supplémentation a amélioré uniquement le maximum théorique de production de gaz sans modifier le temps de latence et la vitesse maximale de production de gaz.

 

Mots clés:cellulase, digestibilité, grignond’olive, xylanase

 

Read more

Etude in vitro de l’effet de la concentration en enzymes fibrolytiques exogènes sur l’utilisation digestive des pulpes de tomates

K. ABID

H. YAICH

J. JABRI

A. MALEK

J. REKHIS

M. KAMOUN

 

École Nationale de Médecine Vétérinaire, Service d’alimentation et de nutrition animale: Sidi Thabet – Tunis, Tunisie.

 

Abstract-In the literature, studies concerning the effect of exogenous fibrolytic enzymes on ruminal digestibility of by-products are very limited even absents for some by-products in particular of tomato pomace. In this context, we suggest to study the effect of such supplementation at different concentrations on digestibility of this by-product that is very abundant in Tunisia. Therefore, the gas production technique in vitro in the syringes was used to examine the fermentation characteristics. An enzymatic complex constituted by a mixture of cellulase and xylanase (1: 1, v / v) was used following increasing concentrations (C0 = 0, C1.2 = 1.2, C2.4= 2.4, C4.8 = 4.8, C9.6 =9.6 and C19.2 = 19.2 mg / g DM). Compared to the control diet (untreated: C0), the organic matter degradability, metabolizable energy and short-chain fatty acids are improved significantly (P <0.05) only with C1.2 concentration. With C2.4 concentration, these parameters remain the same as the control diet (P> 0.05). On the other hand, with higher concentrations (from C4.8 to C19.2), these values decrease significantly (P <0.05). That supplementation has no significant effect on most of the parameters of the kinetics of GP. It is only with the higher concentrations (from C4.8 to C19.2) the fermentation rate is reduced significantly. It appears from this study that exogenous fibrolytic enzymes influence rumen fermentation and the food value only in low concentration (1.2 mg) with higher concentrations, the effect is totally inversed.

 

Keywords: cellulase, xylanase, tomato pomace, digestibility

 

Résumé - Dans la littérature, les études qui concernent l’effet d’une supplémentation en enzymes fibrolytiques exogènes sur la digestibilité ruminale des sous-produits agroalimentaires restent très limitées voire même absentes pour quelques sous-produits notamment les pulpes de tomates. Dans ce contexte, nous proposons d’étudier l’effet d’une telle supplémentation à différentes concentrations sur l’utilisation digestive de ce sous-produit disponible en grandes quantités en Tunisie. De ce fait, la technique de production de gaz in vitro dans les seringues a été utilisée pour examiner les caractéristiques fermentaires de l’aliment. Un complexe enzymatique constitué d’un mélange de cellulase et de xylanase (1:1, v/v) a été utilisé suivant des concentrations croissantes (C0 = 0, C1.2 = 1.2, C2.4 = 2.4, C4.8 = 4.8, C9.6 = 9.6 et C19.2 = 19.2 mg/ g MS). Par rapport à l’aliment témoin (non supplémenté : C0), la digestibilité de matière organique, la teneur en énergie métabolisable et la production d’acides gras volatils se sont améliorées d’une manière significative (P < 0.05) uniquement avec la concentration C1.2. Avec la concentration C2.4, ces paramètres restent identiques à ceux de l’aliment témoin (P > 0.05). Par contre, avec des concentrations plus élevées (de C4.8 à C19.2), ces valeurs diminuent d’une manière significative (P < 0.05). On note que la supplémentation n’a pas d’effet significatif sur la plupart des paramètres de la cinétique de production de gaz quelle que soit la concentration du complexe. C’est uniquement avec les concentrations élevées (de C4.8 à C19.2) que la vitesse de fermentation a diminué d’une manière significative. Il ressort de cette étude que les enzymes fibrolytiques exogènes n’influencent la fermentation ruminale et la valeur alimentaire du sous-produit utilisé qu’avec une faible concentration (1.2 mg d’enzymes/ g de MS). Avec des concentrations plus élevées, l’effet est totalement inverse.

 

Mots clés: cellulase, xylanase, pulpes de tomate, digestibilité

 

Read more

Exploitation des techniques de cultures in vitro pour la sélection contre V. dahliae chez l'olivier

A. CHAARI RKHIS1*

Y. GHARBI1

M.CHEFFI1

S.BACCARI2

H.CHATTI1

M.A. TRIKI1

 

1 Institut de l'olivier. Université de Sfax. Route de l’aéroport Km2. 3032 Sfax .Tunisie.

2 Faculté des Sciences de Sfax. Université de Sfax. Route de la Soukra Km 4.Sfax 3042.Tunisie

 

Abstract - Olive tree has few enjoyed of multiple benefits of biotechnological techniques. In Tunisia, local olive cultivars were successfully micropropagated by axillary buds and tested under controlled conditions for their tolerance to Verticillium dahliae, which is one of the major disease affecting olive trees in Tunisia. In this study, three months old seedling belong to the cultivars Chemlali and Arbequina have been grown in liquid media containing two different concentrations of culture filtrate of V. dahliae (25 and 50 mL / L). After four months of growth at 24 ° C and a photoperiod of 16 hours, the number of dead plants in the two cultivars seedlings treated with the two concentrations of fungal filtrate was significantly higher than that recorded in the control group. By contrast, no significant difference was observed in the growth of tolerant plants when compared to those of the control. Tolerant seedlings were acclimated and prepared to confirm their tolerance towards V. dahliae infection by new tests in vivo. These results are important and may contribute in the improvement of olive genetic resources to control effectively some dieback diseases such as Verticillium wilt of olive trees and the threat of the bacterium Xylella fastidiosa in all the Mediterranean countries, which lay the ground to select tolerant cultivars for areas with high risk of infection.

 

Keywords - Olivie tree, Micropropagation, tolerance, Verticillium dahliae, in vitro culture

 

Résumé - La biotechnologie constitue une imposante composante de toutes stratégies de recherche relatives à l'amélioration génétique des espèces végétales. En effet, devant une demande quantitative croissante et surtout qualitative pressante, les techniques classiques employées pour la création de nouveaux individus chez végétaux sont relativement lentes et toujours limitées. En revanche, les multiples techniques biotechnologiques peuvent remédier efficacement à beaucoup d'insuffisances et raccourcir les délais par la sélection rapide de nouveaux individus. L'olivier a très peu profité des avantages de ces techniques. En Tunisie, des essais ont été entamés, dans une première phase, pour multiplier les variétés locales in vitro et actuellement, toutes les étapes de la micropropagation par les bourgeons axillaires sont maîtrisées et brevetées. Partant de ces résultats, des essais pour la sélection et la multiplication d’individus tolérants à la verticilliose de l’olivier ont été entrepris. De jeunes oliviers, âgés de 3 mois, issus de semis des variétés Chemlali de Sfax et Arbequina ont été cultivés in vitro sur des milieux liquides contenant deux concentrations de filtrat de culture de V. dahliae (25 et 50 ml/l préparés à partir d’une solution de 104 spores/l). Après 4 mois de croissance à 24°C et à une photopériode de 16 heures, le nombre de plantes mortes est significativement plus important chez les jeunes oliviers des 2 variétés inoculées aux deux doses de filtrat fongique par rapport aux témoins sains. Alors qu’aucune différence significative n’a été observée dans la croissance des plantes inoculées vivantes et les témoins. Les oliviers tolérants ont été acclimatés et sortis à l’ombrière pour confirmer leur tolérance vis-à-vis des attaques de V. dahliae par d’autres tests in vivo. Ces résultats sont d’une importante capitale surtout avec l’aggravation de certaines maladies de dépérissement telles que la verticilliose de l’olivier et la menace de la bactérie Xylella fastidiosa dans tous les pays du bassin méditerranéen, ce qui obligent les intervenants dans le secteur à sélectionner le plus rapidement possible des individus sains et tolérants.

 

Mots clés: Olivier, Micropropagation, tolérance, Verticillium dahliae, culture in vitro

 

Read more

Optimisation de la réaction en chaine polymérase des microsatellites par un vecteur de bactérie M13

R. BACCOUCHE1*

B.JEMMALI2

H. OULEDAHMED3

M. BEN HAMOUDA4

 

1Institut National Agronomique de Tunis (INAT)

2 Ecole Supérieure d’Agriculture de Mateur

3 Institut de Recherche Vétérinaires de Tunisie

4 Institut National de Recherche Agronomique de Tunisie

 

Abstract - The purpose of this study is the adaptation of the fluorescence technique for optimizing chain reaction polymerase (PCR), 5 among 30 microsatellite markers recommended by FAO for the characterization of genetic resources of the bovine species. In this study, the specific temperatures of the primers have been already determined (57 to 64 ° C). The hybridization temperature of the primer M13 is 53 ° C, 8 final cycles were added at the end of the PCR cycle. These tests were carried out on the basis of tests of two cycles of amplifications and two different concentrations of M13 and SSR primer. It shows in the last analysis, that the adoption of the second cycle of amplification as well as the second concentration of test is most suitable for the optimization of primers. For this reason, these amplifications conditions were adopted for the 220 cattle heads belonging to the Tunisian locals.

 

Keywords - Indigenous Cattle, PCR, microsatellites, M13.

 

Résumé - Le but de cette étude est l’adaptation de la technique de fluorescence pour l'optimisation de la réaction en chaîne polymérase (PCR). 5 parmi les 30 marqueurs microsatellites recommandées par la FAO pour la caractérisation des ressources génétiques de l'espèce bovine ont été utilisés. Dans cette étude, les températures des amorces spécifiques ont déjà été déterminées (57 à 64 ° C). La température d'hybridation de l'amorce M13 est de 53°C, 8 cycles finaux ont été ajoutés à la fin du cycle de PCR. Ces essais ont été réalisés sur la base de tests de deux cycles d'amplifications et deux concentrations différentes de M13 et amorce SSR. Les analyses montrent que l'adoption du deuxième cycle d'amplification ainsi que la deuxième concentration est l'essai est le plus approprié pour l'optimisation des amorces. Pour cette raison, ces conditions d'amplification ont été adoptées pour les 220 têtes de bovine locales au Nord-Ouest de la Tunisie.

 

Mots clès - Bovin autochtones, PCR, microsatellites, M13.



Read more

Copyright

This article is published under license to Journal of New Sciences. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.

CC BY 4.0